MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR307832

Ginkgolide C; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR307832
RECORD_TITLE: Ginkgolide C; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Ginkgolide C
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O11
CH$EXACT_MASS: 440.401
CH$SMILES: CC1C(=O)OC2C(O)C34C5OC(=O)C3(OC3OC(=O)C(O)C43C(C5O)C(C)(C)C)C12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O11/c1-5-12(24)28-11-8(22)18-10-6(21)7(16(2,3)4)17(18)9(23)13(25)30-15(17)31-20(18,14(26)29-10)19(5,11)27/h5-11,15,21-23,27H,1-4H3
CH$LINK: INCHIKEY AMOGMTLMADGEOQ-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE NEGATIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE -2.75 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 4.331234
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M-H]-
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 439.12458514783

PK$SPLASH: splash10-004i-1930000000-d21dba3e577fbcba46ce
PK$NUM_PEAK: 137
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  57.03416 13.0 13
  69.03201 13.0 13
  72.99246 77.0 77
  73.02953 6.0 6
  83.01318 12.0 12
  85.02837 6.0 6
  85.21464 6.0 6
  87.00793 6.0 6
  87.04557 13.0 13
  87.10402 7.0 7
  97.02726 76.0 76
  99.04538 6.0 6
  99.0832 13.0 13
  100.98451 8.0 8
  109.03004 8.0 8
  112.56155 6.0 6
  113.02339 288.0 288
  114.03056 6.0 6
  121.10423 6.0 6
  125.02304 1000.0 999
  126.02253 17.0 17
  126.03026 23.0 23
  127.02853 7.0 7
  127.04044 14.0 14
  130.08029 6.0 6
  133.10094 7.0 7
  136.02032 6.0 6
  137.01842 7.0 7
  137.05666 7.0 7
  139.03746 7.0 7
  139.07919 7.0 7
  141.01744 84.0 84
  142.01968 26.0 26
  143.03391 16.0 16
  143.03957 23.0 23
  147.04306 7.0 7
  149.09628 12.0 12
  151.0387 6.0 6
  158.07646 6.0 6
  160.05354 8.0 8
  163.10707 22.0 22
  165.05643 14.0 14
  166.05801 7.0 7
  166.09752 6.0 6
  173.12978 6.0 6
  174.06148 8.0 8
  174.07077 8.0 8
  177.05925 6.0 6
  177.08763 65.0 65
  178.09201 7.0 7
  179.11574 16.0 16
  179.43307 6.0 6
  181.08961 7.0 7
  183.10243 6.0 6
  187.0377 7.0 7
  188.04333 7.0 7
  190.02739 7.0 7
  191.10339 20.0 20
  191.11188 19.0 19
  192.03659 7.0 7
  192.0813 8.0 8
  192.11763 6.0 6
  193.13054 6.0 6
  195.0932 6.0 6
  195.10239 8.0 8
  197.10831 6.0 6
  200.04597 7.0 7
  202.05864 28.0 28
  202.36276 9.0 9
  203.02979 7.0 7
  203.05951 6.0 6
  203.14487 7.0 7
  207.09224 6.0 6
  208.09253 7.0 7
  208.12875 6.0 6
  209.12074 7.0 7
  213.12097 15.0 15
  215.13605 7.0 7
  215.14772 14.0 14
  217.07648 6.0 6
  219.06859 12.0 12
  219.10155 14.0 14
  219.13959 6.0 6
  223.10074 8.0 8
  225.11629 6.0 6
  228.03616 6.0 6
  228.0482 11.0 11
  230.07907 6.0 6
  230.09402 28.0 28
  230.10405 15.0 15
  231.09665 7.0 7
  231.13817 37.0 37
  233.112 7.0 7
  233.14096 6.0 6
  236.14458 7.0 7
  241.11642 24.0 24
  241.12418 58.0 58
  242.12366 10.0 10
  247.0936 16.0 16
  247.10689 19.0 19
  248.10391 19.0 19
  248.1167 6.0 6
  248.14355 6.0 6
  249.11038 8.0 8
  249.12177 8.0 8
  251.11922 13.0 13
  257.12488 7.0 7
  259.11649 5.0 5
  259.13525 115.0 115
  260.13998 6.0 6
  263.12003 6.0 6
  266.10562 6.0 6
  267.1098 7.0 7
  274.11249 14.0 14
  275.13 9.0 9
  277.14011 25.0 25
  278.15131 8.0 8
  278.89478 6.0 6
  279.12561 6.0 6
  280.12 9.0 9
  297.08441 6.0 6
  303.11514 9.0 9
  303.1283 8.0 8
  304.12613 7.0 7
  304.1376 6.0 6
  307.46609 8.0 8
  309.14352 11.0 11
  319.12088 6.0 6
  321.12927 6.0 6
  321.14157 9.0 9
  342.84052 6.0 6
  365.11386 7.0 7
  365.13306 15.0 15
  383.12131 24.0 24
  383.13467 51.0 51
  384.14334 6.0 6
  412.13593 6.0 6
//

system version 2.2.6-SNAPSHOT
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo