MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303803

Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303803
RECORD_TITLE: Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Ginkgolide B
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O10
CH$EXACT_MASS: 424.402
CH$SMILES: C[C@@H]1C(=O)O[C@H]2[C@H](O)[C@@]34[C@H]5C[C@@H](C(C)(C)C)[C@@]33[C@@H](O)C(=O)O[C@H]3O[C@@]4(C(=O)O5)[C@@]12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O10/c1-6-12(23)28-11-9(21)18-8-5-7(16(2,3)4)17(18)10(22)13(24)29-15(17)30-20(18,14(25)27-8)19(6,11)26/h6-11,15,21-22,26H,5H2,1-4H3/t6-,7+,8-,9+,10+,11+,15+,17+,18+,19-,20-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY SQOJOAFXDQDRGF-MMQTXUMRSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.359533
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 425.1442234

PK$SPLASH: splash10-004i-0386900000-8f6308643b422bb3b9dd
PK$NUM_PEAK: 230
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  55.05659 5.0 5
  69.06559 6.0 6
  74.66629 5.0 5
  105.07487 6.0 6
  109.03346 10.0 10
  113.09183 5.0 5
  121.06905 8.0 8
  121.81543 9.0 9
  127.07694 6.0 6
  131.04967 6.0 6
  137.02167 6.0 6
  145.10597 6.0 6
  147.07867 11.0 11
  149.06311 5.0 5
  153.63832 10.0 10
  156.0632 5.0 5
  157.09901 24.0 24
  159.08215 12.0 12
  159.1207 5.0 5
  160.12315 5.0 5
  163.05629 6.0 6
  163.1181 9.0 9
  165.09875 6.0 6
  169.10556 17.0 17
  173.05247 6.0 6
  174.03534 8.0 8
  177.0461 16.0 16
  177.08557 6.0 6
  178.0766 8.0 8
  182.10396 11.0 11
  183.09102 7.0 7
  185.06773 7.0 7
  185.093 24.0 24
  185.15002 5.0 5
  187.03473 8.0 8
  187.12523 7.0 7
  189.08562 6.0 6
  189.09642 6.0 6
  189.12843 11.0 11
  190.08922 5.0 5
  191.04041 8.0 8
  191.11481 6.0 6
  192.03787 6.0 6
  192.08266 7.0 7
  193.05531 6.0 6
  196.12411 11.0 11
  197.10034 11.0 11
  197.13237 6.0 6
  198.1021 5.0 5
  199.03609 5.0 5
  199.07994 13.0 13
  199.11349 5.0 5
  200.06873 8.0 8
  200.12372 6.0 6
  201.0144 7.0 7
  201.03755 6.0 6
  201.09273 22.0 22
  203.07498 6.0 6
  204.12123 6.0 6
  205.09828 6.0 6
  205.10768 5.0 5
  205.11874 5.0 5
  207.02293 5.0 5
  207.03615 6.0 6
  207.11624 5.0 5
  207.16425 8.0 8
  209.14139 7.0 7
  211.07368 7.0 7
  212.06898 12.0 12
  213.04787 6.0 6
  213.08438 14.0 14
  213.09674 13.0 13
  214.23119 6.0 6
  214.82454 6.0 6
  215.06589 6.0 6
  215.07649 7.0 7
  215.10817 10.0 10
  216.08618 7.0 7
  216.1176 6.0 6
  217.08194 11.0 11
  219.02641 13.0 13
  219.06456 5.0 5
  222.15892 6.0 6
  224.11569 6.0 6
  225.11867 10.0 10
  225.13693 9.0 9
  227.04465 7.0 7
  227.10266 15.0 15
  227.12003 6.0 6
  229.04866 10.0 10
  229.08189 13.0 13
  229.08885 29.0 29
  230.09381 10.0 10
  231.09576 13.0 13
  237.09924 6.0 6
  237.13634 6.0 6
  239.07077 10.0 10
  239.11331 18.0 18
  241.07918 11.0 11
  241.08954 7.0 7
  241.12129 12.0 12
  242.09329 5.0 5
  243.06213 5.0 5
  244.09805 6.0 6
  244.11035 6.0 6
  245.0168 8.0 8
  245.03564 7.0 7
  245.08209 16.0 16
  245.09969 6.0 6
  246.10947 6.0 6
  246.16594 6.0 6
  247.05692 6.0 6
  247.07605 6.0 6
  247.09962 6.0 6
  247.12027 6.0 6
  253.08963 13.0 13
  253.11288 12.0 12
  253.12418 19.0 19
  254.12743 6.0 6
  255.02356 6.0 6
  255.10176 6.0 6
  255.13428 6.0 6
  256.07507 10.0 10
  256.15228 8.0 8
  257.0762 13.0 13
  257.08981 11.0 11
  257.10269 6.0 6
  259.06522 6.0 6
  259.08621 23.0 23
  259.09991 7.0 7
  259.11169 5.0 5
  260.09143 13.0 13
  260.14694 6.0 6
  261.07831 7.0 7
  261.11316 6.0 6
  262.37573 6.0 6
  263.10342 10.0 10
  269.11124 11.0 11
  269.12112 5.0 5
  269.26895 6.0 6
  271.08496 6.0 6
  271.11557 10.0 10
  271.12915 5.0 5
  272.06979 6.0 6
  273.06607 12.0 12
  273.11819 9.0 9
  275.08804 29.0 29
  276.1011 5.0 5
  279.0983 22.0 22
  281.08093 5.0 5
  282.12775 11.0 11
  283.09305 7.0 7
  283.11978 13.0 13
  283.13211 5.0 5
  285.11295 11.0 11
  287.09442 6.0 6
  287.12277 7.0 7
  287.13199 13.0 13
  289.09656 12.0 12
  295.11554 7.0 7
  297.06815 9.0 9
  297.12372 13.0 13
  298.09879 9.0 9
  299.08743 11.0 11
  299.10788 6.0 6
  299.1312 23.0 23
  300.13193 6.0 6
  301.0314 9.0 9
  301.07333 9.0 9
  301.11157 5.0 5
  303.08929 22.0 22
  303.16519 7.0 7
  303.47986 5.0 5
  304.11212 7.0 7
  305.10193 46.0 46
  305.11603 23.0 23
  306.11627 18.0 18
  307.09845 8.0 8
  309.13214 12.0 12
  312.3924 5.0 5
  315.12152 24.0 24
  315.13721 7.0 7
  316.14969 6.0 6
  317.12009 6.0 6
  317.15637 6.0 6
  319.12027 6.0 6
  321.0903 12.0 12
  321.10742 11.0 11
  325.09927 5.0 5
  325.12238 12.0 12
  327.12061 10.0 10
  328.12802 7.0 7
  329.07394 6.0 6
  333.06531 6.0 6
  333.10968 6.0 6
  333.13998 11.0 11
  335.10611 5.0 5
  335.12122 5.0 5
  335.15402 7.0 7
  337.05447 9.0 9
  337.07108 7.0 7
  343.09488 5.0 5
  343.11624 30.0 30
  344.103 16.0 16
  345.12048 10.0 10
  345.1377 22.0 22
  345.14899 6.0 6
  349.11774 6.0 6
  351.14334 9.0 9
  353.10651 16.0 16
  361.05487 5.0 5
  361.07144 5.0 5
  361.10953 15.0 15
  361.13251 168.0 168
  362.12744 10.0 10
  362.14667 8.0 8
  363.12402 5.0 5
  363.1347 9.0 9
  371.11649 16.0 16
  371.20901 8.0 8
  379.15262 10.0 10
  389.11765 17.0 17
  389.13358 32.0 32
  390.09744 12.0 12
  407.11841 10.0 10
  407.13516 9.0 9
  407.1506 10.0 10
  409.13397 17.0 17
  425.11203 17.0 17
  425.14426 1000.0 999
//

system version 2.2.6-SNAPSHOT
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo