MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303545

Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303545
RECORD_TITLE: Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Bergenin
CH$COMPOUND_CLASS: Gallic acid and derivatives
CH$FORMULA: C14H16O9
CH$EXACT_MASS: 328.273
CH$SMILES: COC1=C(O)C=C2C(=O)O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]3C2=C1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C14H16O9/c1-21-11-5(16)2-4-7(9(11)18)12-13(23-14(4)20)10(19)8(17)6(3-15)22-12/h2,6,8,10,12-13,15-19H,3H2,1H3/t6-,8-,10+,12+,13-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY YWJXCIXBAKGUKZ-HJJNZUOJSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 2.8591
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 329.0867085

PK$SPLASH: splash10-0m33-0591000000-fa048c3fd0012fa9dfe0
PK$NUM_PEAK: 189
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  81.03545 32.0 32
  91.057 28.0 28
  93.02793 28.0 28
  103.03851 81.0 81
  110.03288 41.0 41
  115.05128 28.0 28
  115.06119 31.0 31
  116.06373 25.0 25
  119.05489 70.0 70
  120.01479 28.0 28
  121.07181 28.0 28
  122.03967 34.0 34
  123.04508 25.0 25
  124.01068 84.0 84
  131.01112 39.0 39
  131.03732 27.0 27
  131.05396 53.0 53
  131.24596 48.0 48
  133.02788 185.0 185
  134.03165 53.0 53
  134.71703 27.0 27
  136.01355 28.0 28
  137.01851 43.0 43
  138.03748 28.0 28
  139.03337 24.0 24
  142.0479 43.0 43
  146.02895 59.0 59
  146.03954 31.0 31
  147.03754 112.0 112
  150.0309 107.0 107
  150.03925 45.0 45
  151.03264 31.0 31
  151.0448 27.0 27
  151.99951 38.0 38
  152.00974 35.0 35
  152.05034 31.0 31
  153.05547 73.0 73
  159.03233 29.0 29
  159.04221 149.0 149
  159.04811 121.0 121
  160.04616 52.0 52
  162.0318 163.0 163
  164.03552 36.0 36
  165.04407 62.0 62
  165.0527 73.0 73
  166.0571 31.0 31
  173.06458 28.0 28
  175.0354 55.0 55
  175.04387 34.0 34
  176.00928 39.0 39
  176.03967 53.0 53
  176.04527 116.0 116
  177.01242 136.0 136
  177.02779 121.0 121
  177.05812 58.0 58
  178.01369 56.0 56
  178.02359 24.0 24
  178.0652 25.0 25
  179.03606 91.0 91
  180.00806 63.0 63
  181.03867 72.0 72
  181.05023 710.0 709
  182.0619 43.0 43
  187.01039 28.0 28
  187.02718 27.0 27
  187.03896 154.0 154
  189.05504 38.0 38
  190.02393 46.0 46
  190.47641 24.0 24
  191.01628 24.0 24
  191.02995 344.0 344
  191.04599 34.0 34
  193.03522 31.0 31
  193.05411 290.0 290
  194.02019 29.0 29
  194.05469 48.0 48
  194.06229 38.0 38
  194.99184 28.0 28
  195.02724 81.0 81
  195.03386 42.0 42
  196.03485 60.0 60
  197.04395 87.0 87
  197.05545 59.0 59
  198.03995 28.0 28
  198.05394 28.0 28
  201.01396 24.0 24
  202.03088 49.0 49
  203.02528 28.0 28
  204.04056 45.0 45
  205.03261 25.0 25
  205.0502 195.0 195
  205.06081 46.0 46
  206.02477 48.0 48
  206.04991 67.0 67
  207.03445 114.0 114
  207.05353 29.0 29
  207.06528 25.0 25
  207.39436 24.0 24
  208.0376 133.0 133
  208.07285 31.0 31
  209.00801 28.0 28
  209.04576 1000.0 999
  210.04245 25.0 25
  210.05161 42.0 42
  211.02596 34.0 34
  211.05119 76.0 76
  215.03828 91.0 91
  217.03992 69.0 69
  217.05223 76.0 76
  219.03441 72.0 72
  219.05853 160.0 160
  219.07095 191.0 191
  219.48924 28.0 28
  220.03664 28.0 28
  220.68059 65.0 65
  221.03648 185.0 185
  221.05174 230.0 230
  221.06746 29.0 29
  221.08046 45.0 45
  222.04459 34.0 34
  222.05678 39.0 39
  223.02406 66.0 66
  223.05644 31.0 31
  229.04176 34.0 34
  229.05576 24.0 24
  231.02473 83.0 83
  232.03928 25.0 25
  233.03658 154.0 154
  233.04677 380.0 380
  234.01259 28.0 28
  234.04419 28.0 28
  234.05347 24.0 24
  235.05313 24.0 24
  235.06758 105.0 105
  236.03519 29.0 29
  237.66969 25.0 25
  244.02344 28.0 28
  244.45583 25.0 25
  245.02954 34.0 34
  245.04488 25.0 25
  246.04536 42.0 42
  246.05347 38.0 38
  247.02602 24.0 24
  247.04523 24.0 24
  247.05891 212.0 212
  247.06638 98.0 98
  248.03221 28.0 28
  248.06044 126.0 126
  249.0275 24.0 24
  249.04848 79.0 79
  249.07309 93.0 93
  251.04652 199.0 199
  251.05739 627.0 626
  252.04771 28.0 28
  252.05923 29.0 29
  256.05386 32.0 32
  257.03448 27.0 27
  257.04898 74.0 74
  261.00714 25.0 25
  263.05554 616.0 615
  263.06546 165.0 165
  264.05743 25.0 25
  264.06967 56.0 56
  274.84186 24.0 24
  275.05594 588.0 587
  275.96591 27.0 27
  276.05923 28.0 28
  276.0755 25.0 25
  277.05362 29.0 29
  281.05984 59.0 59
  281.0737 122.0 122
  283.07135 24.0 24
  293.04193 27.0 27
  293.05997 311.0 311
  293.07462 345.0 345
  294.06927 35.0 35
  294.07965 24.0 24
  294.93204 29.0 29
  295.0578 28.0 28
  296.06598 28.0 28
  311.05273 28.0 28
  311.0708 271.0 271
  311.08762 132.0 132
  312.07919 55.0 55
  313.09128 52.0 52
  317.30859 25.0 25
  328.06888 72.0 72
  329.07791 273.0 273
  329.09207 575.0 574
//

system version 2.2.6-SNAPSHOT
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo