MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303543

Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303543
RECORD_TITLE: Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Bergenin
CH$COMPOUND_CLASS: Gallic acid and derivatives
CH$FORMULA: C14H16O9
CH$EXACT_MASS: 328.273
CH$SMILES: COC1=C(O)C=C2C(=O)O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]3C2=C1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C14H16O9/c1-21-11-5(16)2-4-7(9(11)18)12-13(23-14(4)20)10(19)8(17)6(3-15)22-12/h2,6,8,10,12-13,15-19H,3H2,1H3/t6-,8-,10+,12+,13-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY YWJXCIXBAKGUKZ-HJJNZUOJSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 2.8591
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 329.0867085

PK$SPLASH: splash10-0560-0930000000-683501a29d69f4481f03
PK$NUM_PEAK: 209
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  57.0365 34.0 34
  67.05581 33.0 33
  83.00796 48.0 48
  85.02712 28.0 28
  87.04157 47.0 47
  102.06186 28.0 28
  103.03885 34.0 34
  103.05799 30.0 30
  105.03671 33.0 33
  107.04927 28.0 28
  107.05362 75.0 75
  119.0397 24.0 24
  119.05035 25.0 25
  121.02603 48.0 48
  122.03956 25.0 25
  126.92678 24.0 24
  127.05384 27.0 27
  130.07225 24.0 24
  131.0506 153.0 153
  131.05672 66.0 66
  132.05092 44.0 44
  132.05644 38.0 38
  133.00334 47.0 47
  133.02736 174.0 174
  133.06487 59.0 59
  134.01552 27.0 27
  134.04161 33.0 33
  135.04089 42.0 42
  137.01923 34.0 34
  138.02461 31.0 31
  138.0321 48.0 48
  142.11107 41.0 41
  144.96555 25.0 25
  145.02603 25.0 25
  145.03452 27.0 27
  145.0667 33.0 33
  146.03889 34.0 34
  147.04506 134.0 134
  148.03938 40.0 40
  148.05254 24.0 24
  149.01312 42.0 42
  149.02 25.0 25
  149.06323 78.0 78
  150.02713 165.0 165
  151.03601 315.0 315
  152.0025 35.0 35
  152.01035 112.0 112
  153.05804 147.0 147
  155.05522 62.0 62
  157.02969 28.0 28
  157.84766 28.0 28
  158.06619 31.0 31
  158.20969 30.0 30
  159.04332 454.0 454
  159.24684 31.0 31
  160.00417 42.0 42
  160.04486 38.0 38
  160.05321 24.0 24
  161.04463 25.0 25
  161.06012 65.0 65
  162.02104 34.0 34
  162.03113 102.0 102
  162.03899 31.0 31
  162.47781 24.0 24
  163.03593 123.0 123
  163.05048 99.0 99
  164.04858 25.0 25
  165.01826 58.0 58
  165.05391 126.0 126
  166.01283 28.0 28
  166.03096 120.0 120
  166.54649 31.0 31
  167.03879 28.0 28
  168.0401 28.0 28
  169.01619 30.0 30
  169.04556 64.0 64
  171.04668 34.0 34
  173.02608 59.0 59
  173.05734 106.0 106
  174.02965 62.0 62
  174.0383 24.0 24
  175.02028 41.0 41
  175.03134 66.0 66
  175.04034 168.0 168
  176.04459 352.0 352
  177.01195 221.0 221
  177.01926 546.0 545
  177.05099 173.0 173
  177.05801 126.0 126
  177.07532 35.0 35
  177.9832 27.0 27
  178.01962 82.0 82
  178.02951 44.0 44
  178.05959 30.0 30
  179.03026 375.0 375
  179.04034 71.0 71
  179.06105 25.0 25
  179.43819 27.0 27
  180.00349 34.0 34
  180.03355 37.0 37
  180.04202 27.0 27
  180.06439 54.0 54
  181.02754 48.0 48
  181.0508 1000.0 999
  182.04521 47.0 47
  182.06018 24.0 24
  182.0683 30.0 30
  183.03761 34.0 34
  183.05205 71.0 71
  184.69543 24.0 24
  185.03773 35.0 35
  186.0313 133.0 133
  187.03992 187.0 187
  187.05559 31.0 31
  189.04529 31.0 31
  189.05627 24.0 24
  190.01982 25.0 25
  190.03383 28.0 28
  190.92938 24.0 24
  191.02246 106.0 106
  191.0336 306.0 306
  191.04581 71.0 71
  191.07259 25.0 25
  191.65384 35.0 35
  192.06288 41.0 41
  192.08099 25.0 25
  193.00471 30.0 30
  193.01891 59.0 59
  193.04858 655.0 654
  193.05531 212.0 212
  194.01709 144.0 144
  195.00256 24.0 24
  195.01869 83.0 83
  195.03294 495.0 495
  195.0531 25.0 25
  197.03075 34.0 34
  197.04828 134.0 134
  198.04433 35.0 35
  199.03502 171.0 171
  201.06134 28.0 28
  202.00305 38.0 38
  202.02063 25.0 25
  204.01912 38.0 38
  205.04385 223.0 223
  205.05418 332.0 332
  206.01381 93.0 93
  206.02147 151.0 151
  206.04877 62.0 62
  207.02097 75.0 75
  207.03239 83.0 83
  207.05946 28.0 28
  208.03239 112.0 112
  209.03963 48.0 48
  210.04309 30.0 30
  210.87233 38.0 38
  211.05154 35.0 35
  214.03748 25.0 25
  215.03667 78.0 78
  216.04366 61.0 61
  217.01657 28.0 28
  217.04593 129.0 129
  218.01894 34.0 34
  218.05798 38.0 38
  219.02736 229.0 229
  219.05379 55.0 55
  219.06546 124.0 124
  220.04756 28.0 28
  221.03195 33.0 33
  221.048 209.0 209
  221.08113 24.0 24
  222.01936 24.0 24
  222.03838 25.0 25
  222.05583 30.0 30
  223.01643 88.0 88
  223.02701 144.0 144
  223.06914 28.0 28
  225.02359 27.0 27
  227.0181 35.0 35
  227.04782 30.0 30
  228.03853 24.0 24
  229.04855 88.0 88
  230.00212 27.0 27
  230.01747 24.0 24
  230.024 68.0 68
  231.02403 28.0 28
  231.06126 28.0 28
  232.04236 28.0 28
  232.05136 42.0 42
  233.04213 366.0 366
  233.08769 30.0 30
  234.04161 66.0 66
  234.05203 123.0 123
  235.05396 31.0 31
  236.07141 24.0 24
  243.01669 66.0 66
  245.02419 28.0 28
  245.04182 113.0 113
  246.04695 33.0 33
  247.06442 66.0 66
  248.02927 86.0 86
  249.03636 61.0 61
  257.04364 28.0 28
  260.01974 47.0 47
  261.03494 37.0 37
  261.05243 25.0 25
  263.05557 153.0 153
  264.05063 24.0 24
  275.04288 24.0 24
  294.06442 42.0 42
//

system version 2.2.6-SNAPSHOT
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo