MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR300616

Palmatine; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR300616
RECORD_TITLE: Palmatine; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Palmatine
CH$COMPOUND_CLASS: Protoberberine alkaloids and derivatives
CH$FORMULA: C21H22NO4+
CH$EXACT_MASS: 352.41
CH$SMILES: COC1=C(OC)C=C2C(CC[N+]3=C2C=C2C=CC(OC)=C(OC)C2=C3)=C1
CH$IUPAC: InChI=1S/C21H22NO4/c1-23-18-6-5-13-9-17-15-11-20(25-3)19(24-2)10-14(15)7-8-22(17)12-16(13)21(18)26-4/h5-6,9-12H,7-8H2,1-4H3/q+1
CH$LINK: INCHIKEY QUCQEUCGKKTEBI-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 4.955133
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 352.153786

PK$SPLASH: splash10-004l-0093000000-4214f4cb575d829a3516
PK$NUM_PEAK: 129
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  191.07263 7.0 7
  204.08258 21.0 21
  205.05324 9.0 9
  206.05995 6.0 6
  217.08572 13.0 13
  218.09921 8.0 8
  219.05783 5.0 5
  219.06775 8.0 8
  220.05389 5.0 5
  220.07014 32.0 32
  220.08032 44.0 44
  221.06752 7.0 7
  221.08081 7.0 7
  221.09071 9.0 9
  222.08337 10.0 10
  222.09206 16.0 16
  229.09081 7.0 7
  230.10023 6.0 6
  231.10658 6.0 6
  232.0779 37.0 37
  233.08194 148.0 148
  234.05727 6.0 6
  234.09209 123.0 123
  235.05913 33.0 33
  235.07005 27.0 27
  235.09941 59.0 59
  235.1073 30.0 30
  236.07137 14.0 14
  236.10185 12.0 12
  236.11298 11.0 11
  245.08139 5.0 5
  246.09094 72.0 72
  247.09982 65.0 65
  248.05383 8.0 8
  248.06087 11.0 11
  248.07393 30.0 30
  248.10689 19.0 19
  249.07724 119.0 119
  250.05421 27.0 27
  250.08652 276.0 276
  251.073 8.0 8
  251.09164 48.0 48
  251.9967 6.0 6
  252.09723 7.0 7
  258.09979 9.0 9
  259.09219 15.0 15
  259.10379 12.0 12
  260.0755 40.0 40
  260.0965 5.0 5
  261.06595 5.0 5
  261.07532 19.0 19
  261.08752 18.0 18
  262.05063 8.0 8
  262.08771 165.0 165
  263.05652 27.0 27
  263.0932 121.0 121
  264.06088 14.0 14
  264.09995 113.0 113
  264.11102 31.0 31
  265.11282 22.0 22
  272.0708 11.0 11
  273.06656 12.0 12
  273.0795 24.0 24
  274.08514 31.0 31
  274.0968 8.0 8
  275.06299 8.0 8
  275.09628 137.0 137
  276.0556 25.0 25
  276.07169 30.0 30
  276.10062 92.0 92
  277.06421 26.0 26
  277.07666 60.0 60
  277.10168 17.0 17
  278.04688 20.0 20
  278.08218 1000.0 999
  278.12109 6.0 6
  279.04715 6.0 6
  279.08771 352.0 352
  280.06931 9.0 9
  280.08844 62.0 62
  281.08868 18.0 18
  288.06812 8.0 8
  289.06339 13.0 13
  289.07858 23.0 23
  290.05115 6.0 6
  290.08145 216.0 216
  291.07803 38.0 38
  291.09024 40.0 40
  291.10593 9.0 9
  292.06033 11.0 11
  292.09784 678.0 677
  293.0563 6.0 6
  293.0838 27.0 27
  293.10114 151.0 151
  294.08432 11.0 11
  294.11432 212.0 212
  295.11224 39.0 39
  295.12622 13.0 13
  296.12183 12.0 12
  302.07898 15.0 15
  303.08551 10.0 10
  304.08853 88.0 88
  304.09976 222.0 222
  305.07059 8.0 8
  305.09467 45.0 45
  305.10709 36.0 36
  306.08084 35.0 35
  306.10284 15.0 15
  308.07346 5.0 5
  308.12817 28.0 28
  316.06674 9.0 9
  318.07684 400.0 400
  319.04111 7.0 7
  319.05252 7.0 7
  319.06985 28.0 28
  319.08276 83.0 83
  320.06247 19.0 19
  320.09296 616.0 615
  320.12933 32.0 32
  321.07446 20.0 20
  321.09595 162.0 162
  322.08826 8.0 8
  322.10516 39.0 39
  334.08408 5.0 5
  334.10767 33.0 33
  334.12292 11.0 11
  335.12137 10.0 10
  336.12131 35.0 35
  337.13187 7.0 7
//

system version 2.2.8-SNAPSHOT
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo